活性污泥丝状菌测量包括两种方法，一种是长度测量，另一种是丰度测量。长度测量有一套标准的程序，具体做法是取一定体积的混合液样，稀释至在显微镜下能辨清每一个菌丝为止，测量被稀释的样品中伸出污泥絮体的所有丝状菌的长度，乘以稀释倍数即为活性污泥丝状菌长度。有两种表示方法，一种是每毫升混合液内丝状菌长度，另一种是单位MLSS中的丝状菌长度。当每gMLSS对应的混合液中的的丝状菌长度小于10m时，该种活性污泥沉降性能良好，大于10m时，沉降性能恶化。并不是丝状菌越少越好，因为丝状菌在污泥絮体中起骨架作用。当丝状菌长度小于0.5m／gMLSS时，该种活性污泥虽沉降速度非常快，但形不成泥水界面，出水混浊。
丝状菌的丰度测量是将混合液在显微镜下直接观察丝状菌的多少。按照丝状菌在污泥絮体上的丰富程度，将丰度分为七级：
第0级：没有。所有絮体上都米见到丝状菌；
第a级：很少。在个别絮体上发现丝状菌；
第b级；一些。不是所有絮体上都有丝状曲；
第c级：一般。所有絮体上都有菌丝，但密度较低。每个絮体上有1～5根菌丝；
第d级：较多。所有絮体上都有菌丝，中等密度。每个絮体上有5～20根菌丝；
第e级：丰富。所有絮体上都有曲丝，密度很高。每个絮体上菌丝超过20根；
第f级：大量。大量菌丝形成丝网。
当活性污泥丝状菌丰度在a～d级时，污泥沉降浓缩性能良好，当为e或f级时，活性污泥处于膨胀状态，沉降性能恶化。当处于0级时，即未发现丝状菌时，活性污泥絮体较松散，极易被曝气设备和回流设备打碎而形成很小的絮体。这种污泥在沉降时很可能沉速较快，但往往形不成泥水界面，上清液浑浊。
